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Richa Gupta, Mikhail Ryzhikov, Olga Koroleva, Mihaela Unciuleac, Stewart Shuman, Sergey Korolev, and Michael S. Glickman. A dual role for mycobacterial RecO in RecA-dependent homologous recombination and RecA-independent single-strand annealing. Nucleic Acids Res.
FAM-labelled MsSSB-Ct peptides were synthesized by LifeTein LLC.
CD81 regulates cell migration through its association with Rac GTPase. Mol. Biol. Cell, December 21, 2012, doi: 10.1091/mbc.E12-09-0642.
TAMRA labeled CD81 peptides were synthesized by LifeTein LLC.
Biotinylated RON2 peptide were synthesized by LifeTein LLC.
 

多肽熒光標記: FITC, FAM, TAMRA, Biotin, EDANS/Dabcyl...

熒光染料是生物分子標記的重要工具。熒光素衍生物可被廣泛地標記在那些用于熒光顯微鏡、流式細胞儀和免疫熒光檢測等領(lǐng)域的試劑上。

FRET Peptide synthesis: FRET Assay

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熒光共振能量轉(zhuǎn)移(Fluorescence resonance energy transfer, FRET)

熒光共振能量轉(zhuǎn)移(FRET)是一種非輻射能量躍遷,通過分子間的電偶極相互作用,將供體激發(fā)態(tài)能量轉(zhuǎn)移到受體激發(fā)態(tài)的過程。此過程沒有光子的參與,所以是非輻射的。該分析方法具有快速、敏感和簡單等優(yōu)點。

用于FRET試驗的染料是可以相同的。但在大多數(shù)應(yīng)用中其實是使用不同的染料。簡單地說,熒光共振能量轉(zhuǎn)移是在供體基團的激發(fā)狀態(tài)下由一對偶極子介導的能量從供體(染料1)向受體(染料2)轉(zhuǎn)移的過程。通常,供體 (Donor)熒光基團的發(fā)射光譜要與受體(Acceptor)基團的吸收光譜有一定的重疊。當這兩個熒光基團間的距離合適時(10 – 100 ?)),就可觀察到熒光能量由供體向受體轉(zhuǎn)移的現(xiàn)象。能量轉(zhuǎn)移發(fā)生方式依賴于受體的化學結(jié)構(gòu):

  • a) 被轉(zhuǎn)化為分子的振動,即發(fā)生能量轉(zhuǎn)移熒光熄滅。(受體是猝光劑)
  • b) 發(fā)射更強于受體本身的特征熒光,造成次級熒光光譜的紅移。 (受體是熒光發(fā)射體)。

FRET Overview: EDANS and Dabcyl

一個供體基團(EDANS)和接受基因(DABCYL)勻被連接到一HIV蛋白酶的天然底物上,當該底物未被切斷時,DABCYL可淬滅EDANS,從而檢測不到熒光。當該底物被HIV-1蛋白酶切斷后,EDANS不再被DABCYL淬滅,隨即可檢測到EDANS熒光。蛋白酶抑制劑的有效性可憑借EDANS熒光強度的變化進行監(jiān)測。

FRET Peptide synthesis: EDANS and Dabcyl

FRET肽是研究肽酶特異性的便利工具,由于其反應(yīng)過程可被連續(xù)監(jiān)測,為酶活性的檢測提供了一個便捷的方法。供體/受體對的肽鍵水解后產(chǎn)生的熒光可衡量納摩爾級濃度的酶活性。當FRET肽是完整的,表現(xiàn)出的是內(nèi)部的熒光猝滅,但當供體/受體對的任何肽鍵斷裂就會釋放出熒光,此熒光可被連續(xù)檢測,從而可對酶的活性進行定量分析。

FRET 肽可作為各類酶研究的合適底物,比如:

  1. 肽酶、蛋白酶、激酶、磷酸酶的動力特征和功能特征。
  2. 對新的蛋白水解酶的篩選和檢測。
  3. 對多肽折疊的構(gòu)象研究。

以下是一些用于FRET的標準染料組合::

  1. Fluorescein and Dabcyl:FAM/Lys(Dabcyl)
  2. Fluorescein and Tamra: FAM/TAMRA
  3. Methoxy-coumarin-acetic-acid(MCA) and 2,4-Dinitrophenyl(DNP): MCA/Lys(Dnp).
  4. Ortho-aminobenzoic acid (Abz) and 2,4-dinitrophenyl (Dnp) or N-(2,4-dinitrophenyl)ethylenediamine (EDDnp): Abz/Tyr (NO2), Abz/EDDnp
  5. Dabcyl and Glu(EDANS)

在蛋白酶的多肽底物內(nèi)經(jīng)共振能量轉(zhuǎn)移引發(fā)熒光猝滅的供體-接受對

 

波長(nm)

猝滅劑

熒光團

激發(fā)波

發(fā)射波

Dabcyl
Dansyl
DNP
DNP
DNP
Tyr (NO2)

Edans
Trp
Trp
MCA
Abz
Abz

336
336
328
328
328
320

490
350
350
393
420
420


常規(guī)RET供體-接受對的福斯特臨界距離(Forster Critical Distance)

Donor

Aceptor

Forster Distance
(Nanometers)

Tryptophan
IAEDANS (1)
BFP
Dansyl
Dansyl
CFP
CF (3)
Fluorescein
Cy3
GFP
BODIPY FL (4)
Rhodamine 6G
FITC
B-Phycoerythrin
Cy5

Dansyl
DDPM (2)
DsRFP
FITC
Octadecylrhodamine
GFP
Texas Red
Tetramethylrhodamine
Cy5
YFP
BODIPY FL (4)
Malachite Green
Eosin Thiosemicarbazide
Cy5
Cy5.5

2.1
2.5-2.9
3.1-3.3
3.3-4.1
4.3
4.7-4.9
5.1
4.9-5.5
>5.0
5.5-5.7
5.7
6.1
6.1-6.4
7.2
>8.0

(1): 5-(2-iodoacetylaminoethyl)aminonaphthalene-1-sulfonic acid
(2): N-(4-dimethylamino-3,5-dinitrophenyl) maleimide
(3): carboxyfluorescein succinimidyl ester
(4): 4,4-difluoro-4-bora-3a, 4a-diaza-s-indacene

FITC

FITC Peptide synthesis: FITC modification

異硫氰酸熒光素(FITC)與羧基熒光素相比更具活性,而且后者需要被激活才能使用。FITC主要是與巰基反應(yīng),如還原型半胱氨酸的側(cè)鏈,尤其是多肽或蛋白中的氨基。

FITC Peptide synthesis: FITC labeling process

對眾多應(yīng)用來說,在化學合成過程中引入熒光標記是很容易的。 如在固相合成過程中,F(xiàn)ITC可以與賴氨酸(Lys)或被選擇性地脫保護的鳥氨酸(ornithine)側(cè)鏈,或合成過程中的多肽N端氨基反應(yīng)。當在N端標記時,建議在最后一個氨基和由異硫氰酸酯與氨基反應(yīng)產(chǎn)生的硫脲鍵之間引入烷基間隔器(alkyl spacer),如氨基己酸(Ahx)。

鏈接切割需要酸性環(huán)境,在N端標記FITC的多肽需經(jīng)歷環(huán)化作用來形成熒光素,通常會伴有最后一個氨基酸的去除,但當有一個間隔器如氨基己酸,或者是通過非酸性環(huán)境將目的肽從樹脂上切下來時,這種情況可避免。

空間位阻被認為是在熒光染料前使用Ahx的主要原因,而不是為什么FITC不能直接偶聯(lián)在多肽上的原因。Ahx或b-Ala均可作為間隔器用于FITC標記的多肽上。

FITC Peptide synthesis: FITC

通常,生物素、FITC等染料可任意標記在多肽N端或C端。但我們推薦N端標記,其成功率更高、所需時間更短、更易操作。由于多肽都是從C端往N端合成,所以N端修飾將是固相合成的最后一步,不再需要額外的偶聯(lián)步驟。相反,如果是C端標記,則需要附加步驟,而過程會更復雜。

大多數(shù)染料都是大型的芳香分子,如此龐大分子的介入有助于避免標簽和多肽之間的相互作用。這將有助于保持多肽的構(gòu)象和生物學活性。一般來說,推薦引入一個柔性間隔如Ahx(一個6碳化合物)會使熒光標記更加穩(wěn)定。否則FITC將很容易與其他任何位置的半胱氨酸的巰基或賴氨酸的氨基發(fā)生連接。

Probe Ex (nm) Em (nm) MW Notes
Methoxycoumarin (MCA) 360 410 317 Succinimidyl ester
Fluorescein (FITC) 495 519 389 FITC; pH sensitive
X-Rhodamine 570 576 548 XRITC
Lissamine Rhodamine B 570 590

點擊查看 澤溪源熒光列表,包括吸收峰和發(fā)射峰

多肽合成常見問題解答(FAQs)

點擊查看更多澤溪源多肽合成的FAQs

熒光標記時,肽和修飾標記的染料之間是否需要添加一個間隔?

如何溶解多肽?

我該如何選擇適合自己研究的最佳純度?

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

成功案例1

這個事例闡述了用于FRET檢測的基本方法。熒光分子methoxycoumarine acetic acid(MCA)被標記在多肽的N端,該多肽被設(shè)計作為及基質(zhì)金屬蛋白酶溶基質(zhì)素的底物,在易斷裂的Gly-Leu肽鍵(可被酶水解)之后,連接猝滅劑N-3-(2, 4-dinitrophenyl)-L-2,3-diaminopropionyl(DPA)(Knight el al., 1992)。

完整多肽序列如下:

MCA-Pro-Leu-Gly-Leu-DPA-Ala-Arg-NH2

MCA的最大吸收峰是328nm,最大發(fā)射峰是393nm。 DPA基團在363nm處有很強的吸收譜,并在410nm處有明顯的肩峰。該肩峰與MCA熒光譜重疊,從而導致了顯著的熒光猝滅。

研究發(fā)現(xiàn),1μm MCA-Pro-Leu(酶解產(chǎn)物)溶液的熒光量是等量MCA-Pro-Leu-Gly-Leu-DPA-Ala-Arg-NH2溶液的130倍,其激發(fā)波和發(fā)射波分別為328nm、 393nm。

多肽酶解導致了MCA與DPA基團的分裂,因而MCA熒光大大地增強。熒光增強可隨著時間變化地跟蹤,并可以此度量反應(yīng)速度,研究者借此可以確立該肽作為幾個及基質(zhì)金屬蛋白酶家族成員的底物的Kcat/Km值。此檢測方法最近被用來測定溶基質(zhì)素的潛在抑制能力,即通過酶反應(yīng)的初速度來衡量抑制效果 (Copeland et al., 1995)。

成功案例2

客戶定制了一個疏水性很高的68aa多肽(純度>85%),同時熒光素FITC被標記在該多肽的N端。此多肽合成僅花了4周時間。

HPLC 分析:

Peptide synthesis: FITC modification HPLC

MS 分析:

Peptide synthesis: FITC modification MS

多肽熒光標記、熒光修飾報價:



  • 方法一: 通過在線的報價系統(tǒng)
  •                         peptide synthesis Quote